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Microbial Identification System 微生物同定システム


特徴
ワークフロー



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MicroSeq® Kit

Applied Biosystems 3130ジェネティックアナライザ

Applied Biosystems 3130xl ジェネティックアナライザ

GeneAmp® PCR System 9700
MicroSeqシステムを用いて微生物の受託分析業務を行っている三井農林様のホームページ。
微生物の分類などに関する読み物のページも充実しています。
ぜひご訪問ください。


もし、調べたい生物種がデータベースに無ければこちらでリクエストすることも可能です。
 
製薬、診断学、眼科、食品、化粧品業界等の製造部門では、雑菌等の混入が発見されると、生産の一時停止やロット全体の隔離を余儀なくされるため、無菌状態の管理状況を適切な方法で記録に残すことが重要です。

現行の表現型観察によるバクテリア・真菌の同定では、数日、ときに数週間も要しながら、結果が得られなかったり正確でなかったりすることもあり、時代の要求にはついていけません。

DNA 解析のリーダーであるアプライドバイオシステムズは、遺伝子解析に基づく最先端のソリューションを提供します。高い識別能を備え、バクテリアや真菌のサンプルに対して正確な結果を提供します。

再現性が高い解析結果は、研究室や分析者の違いが影響しないため、施設を超えて共有できます。バリデーション可能なこの系統発生学をベースにしたアプローチは、サンプルテストおよび得られた結果を工程手順やリアルタイムトラッキング機能と統合することによりQA/QC オペレーションを格段と効率化します。

- その日のうちに結果を得られます -
分離培養などの従来法とは異なり、MicroSeq® システムは、特性が明らかにされていないものを含むあらゆるバクテリアと真菌を 明確に同定・分類することができます。さらにこ のシステムは、遺伝子レベルでの近縁種を示す系 統樹を自動的に作成します。



 
特徴

未知のバクテリアを数時間で確実に同定
アプライドバイオシステムズのMicroSeq® システムは現在最も正確なバクテリア同定ソリューションです。生育が遅い、発酵しないなど、様々な理由で従来法では分類できなかった微生物を含め、同定が難しいとされていたサンプルも迅速に同定することが可能です。


真菌の同定
これまで真菌類の同定には、専門家でも結果を得るまでに数週間から数カ月かかるのが一般的でした。さらに、市販の表現型から判定する製品では限られた種類の菌株しか同定できませんでした。アプライドバイオシステムズのMicroSeq® Fungal Identifi cation キットを使用すれば、バクテリアの同定と同様、簡単なワークフローで、最も信頼できる正確な結果を素早くかつ簡単に得ることができます。


高い信頼性を誇る同定
従来、微生物の同定は、酵素による基質変化、炭素源の利 用など主観的な表現型の観察を基に行われてきており、サ ンプルの生理的状態や生育条件に依存したものでした。そ れに比べ、MicroSeq® キットの手法は、16S rDNA のDNA 塩基配列に基づいており、バクテリアの系統分類に新しい 客観的な基準を提供します。微生物の 予備知識も、培養方法や生育環境を考慮する必要がなく、 対象サンプルが生菌か死菌かにも依存しません。

結果はその日に
菌を単離後、培養に時間を取られることなくすぐに同定を始められます。単純で簡単なワークフローで、サンプル入手後12 時間以内に明確な結果を得ることができます。分子生物学者でなくても簡単に結果を読み取ることができ、経験も熟練した検査技術も必要ありません。


完全に統合されたシステム
MicroSeq® 微生物同定システムは、真正細菌、酵母、糸状菌の同定および分類のためのトータルソリューションです。このシステムには下記のツールが含まれています。

迅速で簡単なPrepMan® Ultra サンプル調製試薬とプロトコール
便利なMicroSeq® バクテリア・真菌アプリケーションキット
21 CFR Part 11 に準拠したWindows® OS ベースの使い易い解析ソフトウェア
バクテリアおよび真菌のリボソームDNA 配列のバリデート済みMicroSeq ライブラリ
業界をリードするサーマルサイクラーおよびシーケンシングシステム

アプライドバイオシステムズは充実したサポート体制を用意し、cGMP 施設のための総合的なIQ/OQ/PV サポートを提供します。

 
ワークフロー

迅速で簡単なワークフローにより、 サンプル入手後12 時間で同定終了

MicroSeq® システムのワークフローは、分子生物学の実験経験のない方でも簡単に行えます。このワークフローは、作業時間を極力抑えており、わずか4 ステップで終了します。

1. サンプル調製
1白金耳量の細胞をバクテリアコロニーあるいは純培養物から取り、アプライドバイオシステムズのPrepMan® Ultra 調製試薬等を用いて、短時間の加熱・遠心を行ってDNAを単離します。(30 分未満)
2. DNA 増幅
シーケンシングに必要なDNA 量を得るため、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によりターゲット領域を増幅します。MicroSeq® キットには必要な試薬がすべて含まれており、装置はアプライドバイオシステムズのGeneAmp® PCR システム9700 を使用します。PCR 後の精製は酵素処理あるいは限外ろ過フィルターで迅速に行います。(作業時間10 分、トータル2 時間未満)
3. サイクルシーケンシング
増幅したDNA をテンプレートとして、MicroSeq キットのシーケンス用試薬(プライマーとダイターミネーター)で反応します。未反応のプライマーや色素は短時間の遠心操作で取り除き、Applied Biosystems 3130/3130xl ジェネティックアナライザ等の自動シーケンサで解析します。(作業時間10 分、全ステップ約2 時間未満)
4. 解析と同定
MicroSeq ID ソフトウェアは、自動シーケンサで得られたシーケンスデータを適切なMicroSeq ライブラリと比較し、アライメントアルゴリズムと系統樹に基づいて一致率(% match)を決定します。(10 分未満)
    他に例を見ないライブラリ
    MicroSeq® システムには、1,700 種以上のバクテリア遺伝子のバリデート済みシーケンスデータが登録されています。非発酵グラム陰性菌、Bacillus、コリネフォーム、抗酸菌、Staphylococcus など広範な種をカバーします。真菌類の同定には登録数約1,000 種を超えるライブラリが利用可能です。また、MicroSeq ID ソフトウェアでは、新規、または独自に開発した菌株の塩基配列を登録してカスタマイズすることも可能です。

    正確な種の同定は厳密なバリデーションプロセスにより容易になります。一般に利用されている他のデータベースとは異なり、MicroSeq ライブラリには正確に同定された微生物、微生物系統保存機関の基準株(type strain)から抽出した精度の高い配列だけが含まれています。このライブラリでは多型もサポートしており、病害微生物も含まれています。

    Windows® プラットフォーム対応のMicroSeq® ID 解析ソフトウェアは、使いやすいウィザードで、同定・解析・結果表示を簡素化するパワフルで自動化されたソフトウェアです。このソフトウェアは21CFR Part 11 に準拠しており、監査機能やセキュリティ機能、電子署名機能を備えています。


研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続き上での使用は出来ません。

NOTICE TO PURCHASER:
Please refer to the Applied Biosystems 3130/3130xl Genetic Analyzer and GeneMapper software user's manual for limited label license or disclaimer
information.
The ABI PRISMR 3130 and 3130xl Genetic Analyzer includes patented technology licensed from Hitachi, Ltd. as part of a strategic partnership between
Applied Biosystems and Hitachi, Ltd., as well as patented technology of Applied Biosystems.
The PCR process and 5' nuclease process are covered by patents owned by Roche Molecular Systems, Inc. and F. Hoffmann-La Roche Ltd.
Applied Biosystems, MicroSeq and PrepMan are registered trademarks and AB (Design) and Applera are trademarks of Applera Corporation or its
subsidiaries in the US and/or certain other countries.
GeneAmp and TaqMan are registered trademarks of Roche Molecular Systems, Inc.

記載の社名および製品名は、弊社または各社の商標または登録商標です。
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